一种DNA序列的2D图形表示
石龙;
摘要(Abstract):
本文介绍了DNA序列的一种非退化的2D图形表示,基于图论距离方法将该图形表示转化成了相应的矩阵表示并讨论了它们的数字特征,以便人们对DNA序列作进一步的比较分析。
关键词(KeyWords): DNA序列;图形表示;数字特征
基金项目(Foundation):
作者(Author): 石龙;
Email:
DOI:
参考文献(References):
- [1]张任,张春霆.Z曲线,显示和分析DNA序列的直观工具[J],自然杂志,2001,17:34-38.
- [2]张庆友,许禄,DNA编码序列的图形表示及相似度计算[J],高等学校化学学报,2002.23:1255-1258.
- [3]刘西奎,李艳,许进.DNA序列二维图形表示和有关分析[J].自然科学进展,2004,14:1032-1038.
- [4]张宝华,王海水,许禄,吴迪.DNA一级序列不同编码方法和相似度比较[J].计算机与应用化学,2007,24(1):45-48.
- [5]周迎春,骆嘉伟,杨莉,基因序列图形表达及聚类分析应用研究[J].计算机应用,2007,27(9):2330-2333.
- [6]骆嘉伟,张惜珍.一种新的基于3D图形的进化数构造方法[J],武汉理工大学学报,2007,29(4):24-27.
- [7]迟锐,高随祥.DNA序列的3D图形表示[J].中国科学院研究生院学报,2007,24(3):280-286.
- [8]张玉森,廖波.基于3-D图形表示的DNA序列的相似性分析[J].生物数学学报,200722(4):583-590.
- [9]赵熙强,牟敬君.基于DNA序列四位图形表示的相似性分析[J].中国海洋大学学报,2008,38(2):340-344.
- [10]A.Nandy,M.Harle,S.C.Basak.Mathematical descriptors of DNA sequences:development and applications[J].Arkivo,ix,2006,211:211-238.